Digitoday

Valikko

VTT:n uudella softalla sairauksien jäljille

VTT on kehittänyt megNet-tietokoneohjelmiston monimutkaisten bio- ja lääketieteellisten tietoaineistojen yhdistämiseen ja visualisoimiseen. VTT on käyttänyt ohjelmistoa tutkimusprojekteissa, joissa kehitettiin menetelmiä muun muassa sydänsairauksiin ja diabetekseen liittyvien varhaisten muutosten havaitsemiseksi.
VTT:n mukaan MegNet mahdollistaa laajojen ihmisen fysiologiaan liittyvien tietoaineistojen yhdistämisen ja tietojenkäsittelyn. Tällaisia tekijöitä ovat esimerkiksi molekyylien väliset vuorovaikutukset, genomit, geenien ilmentyminen, soluaineenvaihdunta, lääketieteelliset kuvat ja kliiniset tietoaineistot.

Tutkimuskeskus soveltaa ohjelmaa eri sairauksiin liittyvien, elimistössä tapahtuvien varhaisten muutosten eli biomarkkerien tunnistamiseen. Sitä voidaan hyödyntää myös lääkekehityksessä ja muussa terveydenhoidossa. MegNet-ohjelmisto vastaa tarpeisiin hyödyntää tehokkaasti perustutkimuksen tuloksia potilaiden hoidossa.

Käsitteellinen tila

Ohjelman kehitystyö perustuu käsitteellinen tila -teoriaan (conceptual space), joka soveltuu tiedon louhintaan ja visualisointiin. VTT hyödynsi työssä uusimpia 3d-tekniikoita, matemaattista mallinnusta ja kontekstin tunnistusta. Käsitteellinen tila -teoria yhdistää kognitiivisen tieteen, psykologian ja lingvistiikan teorioita. Se tarkoittaa ennalta valittujen ominaisuuksien mukaan järjestettyä tilaa ja perustuu informaatiotilan topologiseen analysointiin.

VTT on soveltanut megNet-ohjelmistoa tutkimusprojekteissaan. VTT:n rahoittamassa Visubiomed-projektissa systeemibiologian, signaalinkäsittelyn ja lääketieteellisen kuvankäsittelyn asiantuntijat analysoivat sydämestä otettuja magneettikuvia ja jatkossa muutakin sydänsairauksiin liittyvää kliinistä tietoaineistoa. Potilaiden verinäytteistä voidaan analysoida aineenvaihduntatuotteet.

Tietoaineistoa täydennetään MegNet-ohjelmiston avulla sairauteen liittyvällä molekyylitason tutkimustuloksilla ja molekyylien vuorovaikutustiedoilla. Transcendo-projektissa VTT:n tutkijat ovat soveltaneet megNetiä diabeteksen varhaisen havaitsemisen diagnoimiseksi.

Hanke tehdään yhteistyössä sairaaloiden kanssa.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Yksi kuoli rekan pudottua moottoritieltä Lohjalla – erikoinen tapahtumaketju johti karmeaan turmaan

    2. 2

      Jaana, 54, sai Alkosta potkut pitkien kynsien takia: ”Tämän ikäiselle yksikätiselle naiselle ei töitä löydy”

    3. 3

      Mystinen toimintahäiriö jätti 2-vuotiaan turkulaisen hissin vangiksi

    4. 4

      Pizzalähettiä odotti imatralaisen kodin ovella harvinaisen röyhkeä kohtelu – kolmen pizzan hinnaksi tuli lopulta yli 350 euroa

    5. 5

      ”Eräs miljonääri haki sokerinkin Virosta” – psykologi: Saituus saa alkunsa potalta

    6. 6

      Axl Smith kirjoitti someen uhmakkaasti – uhrit ahdistuivat: ”Osa on kokenut uhkaavana”

    7. 7

      Snookertähden turnaus päättyi julmasti – ”Kamalin mahdollinen tapa hävitä”

    8. 8

      Ylipainoinen opiskelija laihdutti lähes puolet painostaan – on nyt mallikaunotar: Nöyryyttävä tilanne avasi silmät todellisuudelle

    9. 9

      Mikä on Juhani Tammisen tulevaisuus tv:n kiekkoasiantuntijana? ”Värikkäät persoonat jakavat mielipiteet”

    10. 10

      Tällainen on Bernerin esitys: Autot halpenevat, ajaminen kallistuu, mustia laatikoita ei tule...

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Nainen synnytti salaa vessassa – raskaudesta tietämättömät vanhemmat havahtuivat pamaukseen

    2. 2

      Tänään tv:ssä: Pihla Viitala täysin alastomana Hollywood-debyyttissään: ”En saanut silmiäni irti hänestä”

    3. 3

      Yle paljasti jo: Autovero pois – ajoneuvo- ja polttoaineveroja lasketaan

    4. 4

      Yllätys Urheilugaalassa – Kimi Räikkönen asteli lavalle ja piti pitkän puheen: ”Ittekin tekemällä voi tulla ihan hyvä lopputulos”

    5. 5

      Kimi Räikkösen saapuminen Hartwall-areenaan oli tarkoin varjeltu salaisuus – ”Sovimme Kimin kanssa, miten nämä asiat hoidetaan”

    6. 6

      Axl Smith kirjoitti someen uhmakkaasti – uhrit ahdistuivat: ”Osa on kokenut uhkaavana”

    7. 7

      Juopuneet suomalaiskaverukset lensivät ulos baarista juuri ennen ammuskelua – pelastuivat verilöylyltä

    8. 8

      Axl Smithin uhrien joukossa julkisuudesta tuttuja henkilöitä – tapaus tänään käräjillä

    9. 9

      Urheilugaalan tunteikkain hetki – tyttäret noutivat menehtyneen Aki Hintsan palkinnon: ”Surun keskellä olemme kiitollisia”

    10. 10

      Eläkeläisnaisen auto hajosi Pohjanmaalla – ventovieras tarjosi 350 kilometrin kyydin Helsinkiin sairasta aviomiestä katsomaan

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Madonna julkaisi haarovälikuvan – Piers Morgan: ”Oksensin aamupalani”

    2. 2

      Poliisi ampui miehen maaliskuussa – vainajan autosta löytyi kolkko kirje

    3. 3

      Valesotilas yritti huijata – Tiina vedättikin takaisin: ”Naurettiin ukkoni kanssa niin, että mahaan koski”

    4. 4

      Häikäisevän kaunis morsian! Mika Häkkinen ja Marketa pääsivät poroajelun kyytiin – suloiset lapset mukana

    5. 5

      Mikan ja Marketan rakkaustarina – saksalaislehti paljasti kaunottaren menneisyyden

    6. 6

      Perhe etsii vastausta kammottavaan kuvaan – mitä tai mikä ilmestyi yhtäkkiä yöllä kotipihalla otettuun valokuvaan?

    7. 7

      Kolme povekasta blondia: Natalie, 45, sekoitetaan jatkuvasti tyttäriinsä – erotatko kuvista kuka on äiti?

    8. 8

      Nainen synnytti salaa vessassa – raskaudesta tietämättömät vanhemmat havahtuivat pamaukseen

    9. 9

      Patrik Laineen sydän on puhdasta kultaa – vastasi pienen fanin kirjeeseen ikimuistoisella tavalla

    10. 10

      Suomalaisten kasvoilla näkyvä silmälasimalli on auttamattomasti out

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Yksi kuoli rekan pudottua moottoritieltä Lohjalla – erikoinen tapahtumaketju johti karmeaan turmaan

    2. 2

      Jaana, 54, sai Alkosta potkut pitkien kynsien takia: ”Tämän ikäiselle yksikätiselle naiselle ei töitä löydy”

    3. 3

      Mystinen toimintahäiriö jätti 2-vuotiaan turkulaisen hissin vangiksi

    4. 4

      Pizzalähettiä odotti imatralaisen kodin ovella harvinaisen röyhkeä kohtelu – kolmen pizzan hinnaksi tuli lopulta yli 350 euroa

    5. 5

      ”Eräs miljonääri haki sokerinkin Virosta” – psykologi: Saituus saa alkunsa potalta

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Nainen synnytti salaa vessassa – raskaudesta tietämättömät vanhemmat havahtuivat pamaukseen

    2. 2

      Tänään tv:ssä: Pihla Viitala täysin alastomana Hollywood-debyyttissään: ”En saanut silmiäni irti hänestä”

    3. 3

      Yle paljasti jo: Autovero pois – ajoneuvo- ja polttoaineveroja lasketaan

    4. 4

      Yllätys Urheilugaalassa – Kimi Räikkönen asteli lavalle ja piti pitkän puheen: ”Ittekin tekemällä voi tulla ihan hyvä lopputulos”

    5. 5

      Kimi Räikkösen saapuminen Hartwall-areenaan oli tarkoin varjeltu salaisuus – ”Sovimme Kimin kanssa, miten nämä asiat hoidetaan”

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Madonna julkaisi haarovälikuvan – Piers Morgan: ”Oksensin aamupalani”

    2. 2

      Poliisi ampui miehen maaliskuussa – vainajan autosta löytyi kolkko kirje

    3. 3

      Valesotilas yritti huijata – Tiina vedättikin takaisin: ”Naurettiin ukkoni kanssa niin, että mahaan koski”

    4. 4

      Häikäisevän kaunis morsian! Mika Häkkinen ja Marketa pääsivät poroajelun kyytiin – suloiset lapset mukana

    5. 5

      Mikan ja Marketan rakkaustarina – saksalaislehti paljasti kaunottaren menneisyyden

    6. Näytä lisää