Digitoday

Valikko

Uudella softalla sairauksien jäljille

VTT on kehittänyt megNet-tietokoneohjelmiston monimutkaisten bio- ja lääketieteellisten tietoaineistojen yhdistämiseen ja visualisoimiseen. VTT on käyttänyt ohjelmistoa tutkimusprojekteissa, joissa kehitettiin menetelmiä muun muassa sydänsairauksiin ja diabetekseen liittyvien varhaisten muutosten havaitsemiseksi.
VTT:n mukaan MegNet mahdollistaa laajojen ihmisen fysiologiaan liittyvien tietoaineistojen yhdistämisen ja tietojenkäsittelyn. Tällaisia tekijöitä ovat esimerkiksi molekyylien väliset vuorovaikutukset, genomit, geenien ilmentyminen, soluaineenvaihdunta, lääketieteelliset kuvat ja kliiniset tietoaineistot.

Tutkimuskeskus soveltaa ohjelmaa eri sairauksiin liittyvien, elimistössä tapahtuvien varhaisten muutosten eli biomarkkerien tunnistamiseen. Sitä voidaan hyödyntää myös lääkekehityksessä ja muussa terveydenhoidossa. MegNet-ohjelmisto vastaa tarpeisiin hyödyntää tehokkaasti perustutkimuksen tuloksia potilaiden hoidossa.

Käsitteellinen tila

Ohjelman kehitystyö perustuu käsitteellinen tila -teoriaan (conceptual space), joka soveltuu tiedon louhintaan ja visualisointiin. VTT hyödynsi työssä uusimpia 3d-tekniikoita, matemaattista mallinnusta ja kontekstin tunnistusta. Käsitteellinen tila -teoria yhdistää kognitiivisen tieteen, psykologian ja lingvistiikan teorioita. Se tarkoittaa ennalta valittujen ominaisuuksien mukaan järjestettyä tilaa ja perustuu informaatiotilan topologiseen analysointiin.

VTT on soveltanut megNet-ohjelmistoa tutkimusprojekteissaan. VTT:n rahoittamassa Visubiomed-projektissa systeemibiologian, signaalinkäsittelyn ja lääketieteellisen kuvankäsittelyn asiantuntijat analysoivat sydämestä otettuja magneettikuvia ja jatkossa muutakin sydänsairauksiin liittyvää kliinistä tietoaineistoa. Potilaiden verinäytteistä voidaan analysoida aineenvaihduntatuotteet.

Tietoaineistoa täydennetään MegNet-ohjelmiston avulla sairauteen liittyvällä molekyylitason tutkimustuloksilla ja molekyylien vuorovaikutustiedoilla. Transcendo-projektissa VTT:n tutkijat ovat soveltaneet megNetiä diabeteksen varhaisen havaitsemisen diagnoimiseksi.

Hanke tehdään yhteistyössä sairaaloiden kanssa.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Kuvat: Isännöitsijää odotti asukkaan kodissa puistattava yllätys

    2. 2

      13-vuotias uhkaa vanhempiaan poliisilla – äiti pyytää apua

    3. 3

      Ohiajaneen ambulanssin työntekijöiden tarkkaavaisuus pelasti perheen tulipalolta: ”Sankarillisesti toimivat”

    4. 4

      Jelena Välbe hätkähdytti t-paidallaan MM-hiihdoissa – legenda on tyytyväinen, ettei Putin tule Lahteen

    5. 5

      Punakoneen kiekkolegenda Vladimir Petrov kuollut

    6. 6

      Näin suomalaiset lorvailevat töissä: olemattomia palavereja ja harhauttavia ruutukaappauksia

    7. 7

      Haiseeko pyykkisi pahalta pesun jälkeen? Näin pääset hajuista eroon

    8. 8

      Mikael Granlund ratkaisi pelin yksin jatkoajalla – katso videolta hykerryttävä soolomaali

    9. 9

      Halle Berry, 50, pulahti Oscar-asusta suoraan naku-uinnille – julkaisi kiusoittelevan videon

    10. 10

      Tv-katsojat hieraisivat silmiään: Anssi Kela näkyi neljällä kanavalla yhtä aikaa – ”Onko tässä enää mitään tolkkua”

    11. Näytä lisää
    1. 1

      ”Uimarenkaat omasta takaa” Katri Sorsan rehellinen kuva kertoo enemmän kuin tuhat sanaa

    2. 2

      Diabetes on hiipivä sairaus – tunnista 20 kavalaa merkkiä

    3. 3

      Petter Northugin viesti tv-kameran edessä Emil Iversenille: ”Hyvä, että kaadoit myös suomalaisen”

    4. 4

      Norjalaiset raivostuivat Emil Iversenin nöyryyttämisestä suorassa lähetyksessä

    5. 5

      Sliipatun pukumiehen kodista paljastui mykistävä yllätys – toukat ryömivät isännöitsijää vastaan

    6. 6

      Miksi apeat pronssimitalistit repesivät yhtäkkiä nauramaan? Jauhojärvi paljasti IS:lle Niskasen sanat palkintopallilla

    7. 7

      Helsinkiläismies eli niin kuin naistenlehdissä kehotettiin – tässä kuvassa hän lataa kotona akkuja

    8. 8

      Aino-Kaisa Saarinen kertoo hetkestä, jolloin hänen unelmansa romahti: ”Vastauksena oli hiljaisuus”

    9. 9

      Mieti ennen kuin ostat: Uudesta Nokia 3310 -puhelimesta paljastui paha puute

    10. 10

      Nokian murhaepäily: 17-vuotiaan tytön kuolinsyy selvisi

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Julkkiksilta sataa tukea rumaksi haukutulle Maria Veitolalle – Rakel Liekiltä tyhjentävä kommentti

    2. 2

      Helsinkiläinen Nina, 44, avautuu isäpuolen järkyttävistä teoista: ”Äiti katseli vierestä, mutta ei koskaan puuttunut”

    3. 3

      Kummisetä antoi 10-vuotiaalle tyttärelle lahjarahaa – Kela rokotti koko perheeltä 341,52 euroa/kk

    4. 4

      Traaginen onnettomuus Helsingissä – työkoneen kauha osui kävelijään, nainen kuoli vammoihinsa

    5. 5

      Marika saa Espanjassa pitkiä katseita – suomalaiset nimet, jotka eivät toimi ulkomailla

    6. 6

      Tarkista ja kuuntele: Mikä oli Suomen listaykkösenä, kun sinä synnyit?

    7. 7

      Yleinen virhe wc-pöntöllä: Tästä syystä pyttyyn jää helposti ”jarrutusjäljet”

    8. 8

      4 eri mitoilla varustettua miestä avautuu seksielämästään: ”Teen parhaani sillä, mitä minulla on”

    9. 9

      Anu Saagim haukkui Maria Veitolaa rumaksi suorassa lähetyksessä – Veitola harmistui studioyleisön reaktiosta: ”Yleisö nauraa ja taputtaa”

    10. 10

      Katri Sorsalta kuitti Anu Saagimille: ”Eestissä nainen näyttää herättyään tältä, meillä Suomessa tältä...”

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Kuvat: Isännöitsijää odotti asukkaan kodissa puistattava yllätys

    2. 2

      13-vuotias uhkaa vanhempiaan poliisilla – äiti pyytää apua

    3. 3

      Ohiajaneen ambulanssin työntekijöiden tarkkaavaisuus pelasti perheen tulipalolta: ”Sankarillisesti toimivat”

    4. 4

      Jelena Välbe hätkähdytti t-paidallaan MM-hiihdoissa – legenda on tyytyväinen, ettei Putin tule Lahteen

    5. 5

      Punakoneen kiekkolegenda Vladimir Petrov kuollut

    6. Näytä lisää
    1. 1

      ”Uimarenkaat omasta takaa” Katri Sorsan rehellinen kuva kertoo enemmän kuin tuhat sanaa

    2. 2

      Diabetes on hiipivä sairaus – tunnista 20 kavalaa merkkiä

    3. 3

      Petter Northugin viesti tv-kameran edessä Emil Iversenille: ”Hyvä, että kaadoit myös suomalaisen”

    4. 4

      Norjalaiset raivostuivat Emil Iversenin nöyryyttämisestä suorassa lähetyksessä

    5. 5

      Sliipatun pukumiehen kodista paljastui mykistävä yllätys – toukat ryömivät isännöitsijää vastaan

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Julkkiksilta sataa tukea rumaksi haukutulle Maria Veitolalle – Rakel Liekiltä tyhjentävä kommentti

    2. 2

      Helsinkiläinen Nina, 44, avautuu isäpuolen järkyttävistä teoista: ”Äiti katseli vierestä, mutta ei koskaan puuttunut”

    3. 3

      Kummisetä antoi 10-vuotiaalle tyttärelle lahjarahaa – Kela rokotti koko perheeltä 341,52 euroa/kk

    4. 4

      Traaginen onnettomuus Helsingissä – työkoneen kauha osui kävelijään, nainen kuoli vammoihinsa

    5. 5

      Marika saa Espanjassa pitkiä katseita – suomalaiset nimet, jotka eivät toimi ulkomailla

    6. Näytä lisää