Digitoday

Valikko

Uudella softalla sairauksien jäljille

VTT on kehittänyt megNet-tietokoneohjelmiston monimutkaisten bio- ja lääketieteellisten tietoaineistojen yhdistämiseen ja visualisoimiseen. VTT on käyttänyt ohjelmistoa tutkimusprojekteissa, joissa kehitettiin menetelmiä muun muassa sydänsairauksiin ja diabetekseen liittyvien varhaisten muutosten havaitsemiseksi.
VTT:n mukaan MegNet mahdollistaa laajojen ihmisen fysiologiaan liittyvien tietoaineistojen yhdistämisen ja tietojenkäsittelyn. Tällaisia tekijöitä ovat esimerkiksi molekyylien väliset vuorovaikutukset, genomit, geenien ilmentyminen, soluaineenvaihdunta, lääketieteelliset kuvat ja kliiniset tietoaineistot.

Tutkimuskeskus soveltaa ohjelmaa eri sairauksiin liittyvien, elimistössä tapahtuvien varhaisten muutosten eli biomarkkerien tunnistamiseen. Sitä voidaan hyödyntää myös lääkekehityksessä ja muussa terveydenhoidossa. MegNet-ohjelmisto vastaa tarpeisiin hyödyntää tehokkaasti perustutkimuksen tuloksia potilaiden hoidossa.

Käsitteellinen tila

Ohjelman kehitystyö perustuu käsitteellinen tila -teoriaan (conceptual space), joka soveltuu tiedon louhintaan ja visualisointiin. VTT hyödynsi työssä uusimpia 3d-tekniikoita, matemaattista mallinnusta ja kontekstin tunnistusta. Käsitteellinen tila -teoria yhdistää kognitiivisen tieteen, psykologian ja lingvistiikan teorioita. Se tarkoittaa ennalta valittujen ominaisuuksien mukaan järjestettyä tilaa ja perustuu informaatiotilan topologiseen analysointiin.

VTT on soveltanut megNet-ohjelmistoa tutkimusprojekteissaan. VTT:n rahoittamassa Visubiomed-projektissa systeemibiologian, signaalinkäsittelyn ja lääketieteellisen kuvankäsittelyn asiantuntijat analysoivat sydämestä otettuja magneettikuvia ja jatkossa muutakin sydänsairauksiin liittyvää kliinistä tietoaineistoa. Potilaiden verinäytteistä voidaan analysoida aineenvaihduntatuotteet.

Tietoaineistoa täydennetään MegNet-ohjelmiston avulla sairauteen liittyvällä molekyylitason tutkimustuloksilla ja molekyylien vuorovaikutustiedoilla. Transcendo-projektissa VTT:n tutkijat ovat soveltaneet megNetiä diabeteksen varhaisen havaitsemisen diagnoimiseksi.

Hanke tehdään yhteistyössä sairaaloiden kanssa.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Mikä kaunotar! Ivanka Trump, 35, käänsi katseet vaaleanpunaisessa prinsessapuvussaan

    2. 2

      Juha Mieto joutui antamaan periksi nykyajalle – yhdestä periaatteesta hän ei kuitenkaan luovu ikinä

    3. 3

      Tappolistat, agentit, vakoilusatelliitit... 8 salaisuutta, jotka Donald Trump saa tietää virkaan astuttuaan

    4. 4

      Tarjan, 54, tutkinnosta alkoi nöyryyttävä työnhaku – ”Yhtäkään koulutusta vastaavaa työpaikkaa ei tarjottu”

    5. 5

      6 yleistä virhettä, jotka sinäkin luultavasti teet joka kerta suihkussa

    6. 6

      Ainutlaatuiset kuvat jatkosodan legendaarisimmasta sissi-iskusta: näin Petrovski Jam tuhottiin

    7. 7

      Mokkapalat saivat haastajan: Suolaiset kolaneliöt vetivät koko porukan hiljaiseksi

    8. 8

      Trump aloitti Obamacaren purkamisen

    9. 9

      Kumppaniaan pettänyt listaa: ”Olisinpa tiennyt nämä asiat ennen kuin petin”

    10. 10

      Obama jätti jäähyväiset Valkoiselle talolle – valokuvaaja julkaisi vaikuttavan kuvan Instagramissa

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Uimapukumalli Chrissy Teigen jakoi rehellisen kuvan reisistään – miehet hämmentyivät: ”Olen katsonut tätä jo minuutin, ja...”

    2. 2

      IS seurasi hetki hetkeltä: Trumpin ensimmäinen päivä presidenttinä huipentui tanssiaisiin

    3. 3

      Psykologi lataa: ADHD-tyyppisistä oireista suuri osa johtuu vanhemmuuden puutteesta

    4. 4

      Juo aamulla vettä tyhjään vatsaan – 8 mahtavaa vaikutusta

    5. 5

      6 yleistä virhettä, jotka sinäkin luultavasti teet joka kerta suihkussa

    6. 6

      Serbian seksikkäin laulaja Milica, 25, purskahti korsetistaan ulos kesken keikan – yleisö villiintyi

    7. 7

      Haapaveden tragedian sotaveteraani taisteli oikeudessa sairauskorvauksesta – ”Loppuun saakka terävä pää”

    8. 8

      Kiusallinen sekaannus Melania Trumpin ja Michelle Obaman välillä – presidenttiparit pyörivät Valkoisen talon portailla hämmentyneinä

    9. 9

      Jasmin Mäntylä poseeraa topless-kuvassa pelkkä pyyhe lanteillaan – lähettää viestin Instagram-seuraajilleen

    10. 10

      Sarjahukuttajan puhelin hälyttää, mutta missä? Poliisin paikannusyritys jäi tuloksettomaksi

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Juo aamulla vettä tyhjään vatsaan – 8 mahtavaa vaikutusta

    2. 2

      Häikäisevän kaunis morsian! Mika Häkkinen ja Marketa pääsivät poroajelun kyytiin – suloiset lapset mukana

    3. 3

      Mikan ja Marketan rakkaustarina – saksalaislehti paljasti kaunottaren menneisyyden

    4. 4

      Perhe etsii vastausta kammottavaan kuvaan – mitä tai mikä ilmestyi yhtäkkiä yöllä kotipihalla otettuun valokuvaan?

    5. 5

      Serbian seksikkäin laulaja Milica, 25, purskahti korsetistaan ulos kesken keikan – yleisö villiintyi

    6. 6

      Nainen synnytti salaa vessassa – raskaudesta tietämättömät vanhemmat havahtuivat pamaukseen

    7. 7

      Kolme povekasta blondia: Natalie, 45, sekoitetaan jatkuvasti tyttäriinsä – erotatko kuvista kuka on äiti?

    8. 8

      Yksi kuoli rekan pudottua moottoritieltä Lohjalla – erikoinen tapahtumaketju johti karmeaan turmaan

    9. 9

      Dramaattiset kuvat: Myrskypuuska romahdutti rakenteilla olleen, yli 100-neliöisen talon maan tasalle Kuopiossa

    10. 10

      Floridan poliisi julkaisi mykistävän videon rämeeltä – ”Kuka sanoi, että dinosaurukset ovat kuolleet sukupuuttoon?”

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Mikä kaunotar! Ivanka Trump, 35, käänsi katseet vaaleanpunaisessa prinsessapuvussaan

    2. 2

      Juha Mieto joutui antamaan periksi nykyajalle – yhdestä periaatteesta hän ei kuitenkaan luovu ikinä

    3. 3

      Tappolistat, agentit, vakoilusatelliitit... 8 salaisuutta, jotka Donald Trump saa tietää virkaan astuttuaan

    4. 4

      Tarjan, 54, tutkinnosta alkoi nöyryyttävä työnhaku – ”Yhtäkään koulutusta vastaavaa työpaikkaa ei tarjottu”

    5. 5

      6 yleistä virhettä, jotka sinäkin luultavasti teet joka kerta suihkussa

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Uimapukumalli Chrissy Teigen jakoi rehellisen kuvan reisistään – miehet hämmentyivät: ”Olen katsonut tätä jo minuutin, ja...”

    2. 2

      IS seurasi hetki hetkeltä: Trumpin ensimmäinen päivä presidenttinä huipentui tanssiaisiin

    3. 3

      Psykologi lataa: ADHD-tyyppisistä oireista suuri osa johtuu vanhemmuuden puutteesta

    4. 4

      Juo aamulla vettä tyhjään vatsaan – 8 mahtavaa vaikutusta

    5. 5

      6 yleistä virhettä, jotka sinäkin luultavasti teet joka kerta suihkussa

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Juo aamulla vettä tyhjään vatsaan – 8 mahtavaa vaikutusta

    2. 2

      Häikäisevän kaunis morsian! Mika Häkkinen ja Marketa pääsivät poroajelun kyytiin – suloiset lapset mukana

    3. 3

      Mikan ja Marketan rakkaustarina – saksalaislehti paljasti kaunottaren menneisyyden

    4. 4

      Perhe etsii vastausta kammottavaan kuvaan – mitä tai mikä ilmestyi yhtäkkiä yöllä kotipihalla otettuun valokuvaan?

    5. 5

      Serbian seksikkäin laulaja Milica, 25, purskahti korsetistaan ulos kesken keikan – yleisö villiintyi

    6. Näytä lisää