Digitoday

Valikko

Geeni- ja sairaustiedot kerätään samaan järjestelmään

Eurooppalainen tutkimushanke luo yhteistä tietoperustaa geenien ja sairauksien yhteyksistä.


GEN2PHEN-projektin tavoitteena on koota ja yhdistää geenien ja yleisten sairauksien välisistä yhteyksistä kertyvä tieto yhteiseen tietojärjestelmään, jolloin tutkimustulokset pystyttäisiin mahdollisimman nopeasti hyödyntämään myös sairauksien diagnosoinnissa ja hoidossa.

Euroopan komission rahoittama kahdentoista miljoonan euron GEN2PHEN-hanke aikoo valjastaa internetin avuksi sellaisen geneettisen informaation kokoamisessa, jolla on merkittävä vaikutus ihmisen terveyteen ja esimerkiksi sellaisten yleisten sairauksien kuin diabeteksen, lihavuuden, sydänsairauksien ja syövän kehittymiseen.

Hankkeessa on mukana 19 yliopistoa, tutkimuskeskusta ja yritystä kahdestatoista Euroopan maasta sekä Intiasta ja Etelä-Afrikasta. Suomesta hankkeeseen osallistuvat Helsingin yliopiston Meilahden kampuksella toimiva Suomen molekyylilääketieteen keskus FIMM sekä Biocomputing Platforms Ltd Oy.

Projektia johtava professori Anthony Brookes Leicesterin yliopistosta toteaa, että yleisiin sairauksiin liittyvien geneettisten variaatioiden tutkimiseen tarkoitetut teknologiat on kehitetty muutaman viime vuoden aikana ja ne ovat vasta nyt tulossa laajaan käyttöön.

- Odotettavissa on nyt ennennäkemätön ryöppy jännittäviä, arvokkaita ja tärkeitä tutkimushavaintoja. Kuitenkaan ei ole olemassa mitään maailmanlaajuista järjestelmää, joka voisi ottaa vastaan, tallentaa ja yhdistää kaiken tämän tiedon sekä saattaa sen tutkijoiden ulottuville arvioitavaksi ja hyödynnettäväksi, Brookes sanoo.

GEN2PHEN-hanke koordinoi sellaista sähköisen datan kokoamista ja käyttöä, joka selvittää geneettisten variaatioiden yhteyksiä ihmisten välisiin eroihin sairastavuudessa ja lääkevasteissa. Näiden yhteyksien selvittäminen on olennaista diagnostiikan ja hoidon kehittämisessä.

Hankkeen osanottajat kehittävät tietokantojen, työkalujen ja teknologioiden yhdistelmän, jonka avulla kaikki olennainen tutkimuksen tuottama tieto geenivariaatioiden ja sairauksien yhteyksistä pystytään järkevällä tavalla yhdistämään ja saattamaan välittömästi tutkijoiden ulottuville GEN2PHEN Knowledge Centre -portaalin kautta.

Suomalainen tutkimusryhmä osallistuu tietokanta- ja tiedonsiirtostandardien luomiseen sekä tiedon yhdistämisessä tarvittavien menetelmien kehittämiseen, kertoo ryhmää johtava Suomen Genomikeskuksen tietojärjestelmäpäällikkö, FT Juha Muilu.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Mies puukotti isoveljeään – uhri toimitettiin sairaalaan

    2. 2

      Täysyllätys Saara Aallon kotona! Vanhemmat kohtasivat tyttärensä ensi kertaa kuukausiin: ”Lähtö tuli kuin salama kirkkaalta taivaalta”

    3. 3

      Poliisi: Imatran kolmoissurma tallentui valvontakameroille – ”Teko näkyy kameroissa”

    4. 4

      Janni Hussi intiimissä topless-kuvassa – loikoilee pelkät sukkahousut jalassa vuoteella

    5. 5

      Saara Aallolta paljastus X Factor -finaalista: Sharon Osbourne toteuttaa erään Saaran suurimmista unelmista

    6. 6

      Opettaja avautuu: Ennen ehdin opettaa 90 prosenttia työajasta, nyt ehkä neljänneksen – syynä vastuuttomat vanhemmat

    7. 7

      Video: Viron armeija testasi raskaasti aseistettua taistelurobottia – kohteena Lada

    8. 8

      Kommentti: Onko Suomi huomannut, mitä Saara Aalto on maallemme tehnyt?

    9. 9

      Ensimmäiset kuvat: Häkeltynyt Saara Aalto saapui jättiyleisön eteen – ”Olen ihan sekaisin nyt”

    10. 10

      Nainen käveli portaat joka päivä kuukauden ajan – yllättyi lopputuloksesta

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Poliisi IS:lle: Tällainen tausta Imatran epäillyllä 23-vuotiaalla kolmoismurhaajalla on

    2. 2

      Koko ABC tyhjeni ja Ville, 19, jäi yksin lukkojen taakse: ”Olin istumassa tuolla pimeässä nurkassa – tää mesta suljettiin!”

    3. 3

      Silminnäkijä: Imatralla surmattujen viimeiset hetket – tulivat vain käväisemään ravintolassa

    4. 4

      Brittilehdeltä raju väite Saara Aallon finaalipaikasta: Tuotanto käynnisti selvityksen Suomesta annetuista ”kielletyistä äänistä”

    5. 5

      Uskomatonta! Saara Aalto teki sen – pääsi heittämällä X Factor -finaaliin

    6. 6

      Uskomatonta, mutta totta – Aku Ankka ennusti Saara Aallon finaalipaikan jo elokuussa

    7. 7

      Uutisvuoksi julkaisi Imatralla surmattujen toimittajiensa nimet ja koskettavat muistokirjoitukset

    8. 8

      AL: Viiden lapsen yh-äiti sai neloset – paikallinen yrittäjä tarjoutui apuun

    9. 9

      Varo perintöloukkua – ”Voi olla järkevää jopa kieltäytyä perinnöstä”

    10. 10

      Pelkkä silmäys kahteen kuvaan riittää: Patrik Laine ja Sidney Crosby ovat kuin yö ja päivä

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Poliisi IS:lle: Tällainen tausta Imatran epäillyllä 23-vuotiaalla kolmoismurhaajalla on

    2. 2

      Raju huhu Lewis Hamiltonista – ”Se on yksityisasia”

    3. 3

      WhatsApp katoaa miljoonista puhelimista – katso, onko omasi listalla

    4. 4

      7 yleisen syövän varhaiset varoitusmerkit – tunnista ajoissa

    5. 5

      Raakel Lignellin raju painonpudotus ja tiukka ruokavalio johtivat pysyviin terveysongelmiin: ”Riistäytyi vähän käsistä”

    6. 6

      Tuulenvire paljasti Donald Trumpin omituisen ”asumokan” – netti sekosi lentokentältä napatusta kuvasta

    7. 7

      Perhesyyt eivät painaneet? Mika Salolla teoria Nico Rosbergin lopettamisesta: ”Kukaan ei tajua sitä…”

    8. 8

      Todelliset syyt, joiden vuoksi naiset voihkivat seksin aikana

    9. 9

      Nainen teki ”pettämistestin” poikaystävälleen – lopputulos ei ilahduttanut, videolla jo 6 miljoonaa katselukertaa

    10. 10

      Aleksi Valavuori julkaisi matkakuvan Los Angelesista: maisemaotos paljastuikin Ikean sisustustauluksi – some repesi

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Mies puukotti isoveljeään – uhri toimitettiin sairaalaan

    2. 2

      Täysyllätys Saara Aallon kotona! Vanhemmat kohtasivat tyttärensä ensi kertaa kuukausiin: ”Lähtö tuli kuin salama kirkkaalta taivaalta”

    3. 3

      Poliisi: Imatran kolmoissurma tallentui valvontakameroille – ”Teko näkyy kameroissa”

    4. 4

      Janni Hussi intiimissä topless-kuvassa – loikoilee pelkät sukkahousut jalassa vuoteella

    5. 5

      Saara Aallolta paljastus X Factor -finaalista: Sharon Osbourne toteuttaa erään Saaran suurimmista unelmista

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Poliisi IS:lle: Tällainen tausta Imatran epäillyllä 23-vuotiaalla kolmoismurhaajalla on

    2. 2

      Koko ABC tyhjeni ja Ville, 19, jäi yksin lukkojen taakse: ”Olin istumassa tuolla pimeässä nurkassa – tää mesta suljettiin!”

    3. 3

      Silminnäkijä: Imatralla surmattujen viimeiset hetket – tulivat vain käväisemään ravintolassa

    4. 4

      Brittilehdeltä raju väite Saara Aallon finaalipaikasta: Tuotanto käynnisti selvityksen Suomesta annetuista ”kielletyistä äänistä”

    5. 5

      Uskomatonta! Saara Aalto teki sen – pääsi heittämällä X Factor -finaaliin

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Poliisi IS:lle: Tällainen tausta Imatran epäillyllä 23-vuotiaalla kolmoismurhaajalla on

    2. 2

      Raju huhu Lewis Hamiltonista – ”Se on yksityisasia”

    3. 3

      WhatsApp katoaa miljoonista puhelimista – katso, onko omasi listalla

    4. 4

      7 yleisen syövän varhaiset varoitusmerkit – tunnista ajoissa

    5. 5

      Raakel Lignellin raju painonpudotus ja tiukka ruokavalio johtivat pysyviin terveysongelmiin: ”Riistäytyi vähän käsistä”

    6. Näytä lisää