Digitoday

Valikko

Datainfra Euroopan biologiselle tutkimustiedolle

Uudessa EU:n 4,5 miljoonan euron projektissa luodaan eurooppalaisen biologisen tutkimustiedon datalle pysyvä infrastruktuuri.
Euroopan komissio on myöntänyt ELIXIR (European Life Science Infrastructure for Biological Information) -projektille 4,5 miljoonaa euroa valmistelurahaa.

Yleiseurooppalaisen Elixir-projektin valmisteluvaiheen tarkoituksena on löytää paras tapa Euroopan erillisten biologisten dataresurssien yhdistämiseen yhdeksi pysyväksi biotieteiden infrastruktuuriksi.

Korkealla infrastruktuurien ranking-listalla

Tutkimusinfrastruktuureja käsittelevä eurooppalainen strategiafoorumi ESFRI on julkaissut listan merkittävimmistä tutkimuslaitteistoista ja muista infrastruktuureista, joita Eurooppaan tulisi tulevaisuudessa rakentaa. ELIXIR-projekti on yksi näistä.

Tapa, jolla biologista, kuten nukleiinihappoihin, proteiinisekvensseihin ja suurimolekyylisiin rakenteisiin liittyvää tietoa säilytetään, on muuttunut 1980-luvun jälkeen merkittävästi.

Muistivihoista ja akateemisista julkaisuista on päädytty avoimen lähdekoodin tietokantoihin, joissa tietoa on jaettu maailmanlaajuisesti päivittäin.

Nämä tietokannat, ja niissä oleva tieto, ovat korvaamattomia resursseja modernissa biologiassa. Tähän asti ne ovat kuitenkin olleet usein riippuvaisia epävarmasta rahoituksesta, jolloin arvokas data on ollut uhattuna rahoituksen päättyessä.

ELIXIR-projektin tavoite on suojella sekä tietokannoissa jo olemassa olevaa kallisarvoista tietoa että tulevaisuudessa syntyvää dataa. Projekti suunnittelee Eurooppaan optimoidun biotieteiden verkoston, jonka käyttöä tukee vakaa rahoitus.

Tällaisen verkoston perustaminen on strategisesti tärkeä askel, jotta Eurooppa voisi säilyttää johtoasemansa tieteellisessä tutkimuksessa.

Suomesta CSC mukana hankkeessa

ELIXIR-projektia ohjaa eurooppalainen bioinformatiikan tutkimuskeskus EBI (European Bioinformatics Institute). EBI on osa EMBL:ää (European Molecular Biology Laboratory), joka on Euroopan johtava molekyylibiologian tutkimuslaitos. Projektissa on mukana 32 partneria 13 eri maasta.

Tieteen tietotekniikan keskus CSC edustaa Suomea ELIXIRissä. Valmisteluvaiheessa tärkeä tavoite on löytää suomalaisille sopiva rooli muiden eurooppalaisten partnereiden joukossa yhteisessä tutkimuksen infrastruktuurissa.

- On olennaista tunnistaa Suomen tutkimukselle ja elinkeinoelämälle olennaisimmat biologiset dataresurssit ELIXIRissä sekä muodostaa kontakteja ELIXIRin toimintaa täydentäville alueille, kuten lääketieteelliseen tutkimukseen, Tommi Nyrönen CSC:stä sanoo tiedotteen mukaan.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Viranomaisvahvistus: Imatran ampumavälikohtauksessa kolme kuolonuhria

    2. 2

      Uutisvuodon Sipilä-vitsi hämmensi lauantai-iltana – Mitä lähetyksessä tapahtui?

    3. 3

      Imatralla tapahtui öinen ampumavälikohtaus – Yle: Kolme ihmistä kuollut

    4. 4

      Näillä uskomattomilla esityksillä Saara Aalto laittoi tuomarit jälleen polvilleen – katso näyttävät videot

    5. 5

      Hurja tahti jatkuu – Patrik Laine nousi takaisin maalipörssin kärkeen

    6. 6

      Todelliset syyt, joiden vuoksi naiset voihkivat seksin aikana

    7. 7

      Saara Aallon uskomaton esitys lumosi jopa Simon Cowellin: ”Olit sensaatiomainen”

    8. 8

      Arvostettu brittilehti povaa Saara Aallolle koko kisan voittoa – katsojat häkeltyivät huikeista esityksistä: ”Jos tämä olisi ollut finaali, olisit voittaja”

    9. 9

      Toimitusjohtaja oppi puhumaan ranskaa sujuvasti 17 päivässä – näin hän onnistui

    10. 10

      Imatran ampumavälikohtauksen silminnäkijä kertoo IS:lle: ”Näin kuinka joku vietiin raudoissa poliisiautoon”

    11. Näytä lisää
    1. 1

      WhatsApp katoaa miljoonista puhelimista – katso, onko omasi listalla

    2. 2

      Tuulenvire paljasti Donald Trumpin omituisen ”asumokan” – netti sekosi lentokentältä napatusta kuvasta

    3. 3

      New York Times kertoo 44-vuotiaan suomalaismiljonäärin uskomattoman tarinan: luksuselämää ja satojen miljoonien avioerotaistelu

    4. 4

      Vappu Pimiältä roisi paljastus MTV:lle – rinnat täysin paljaana Tanssii Tähtien Kanssa -kulisseissa: ”Mikko repi puvun auki”

    5. 5

      Kurveistaan tunnettu matkabloggaaja vietti kolme viikkoa Suomessa – upeat kuvat villitsevät netissä: ”Mieletön paikka”

    6. 6

      Huoltomiehet yllättyivät suomalaisten nuorten aikuisten uusavuttomuudesta – eivät omista edes ruuvimeisseliä

    7. 7

      Saara Aallon uskomaton esitys lumosi jopa Simon Cowellin: ”Olit sensaatiomainen”

    8. 8

      IS seurasi hetki hetkeltä: Saara Aalto onnistui semifinaalin esityksissään täydellisesti – villitsi tuomarit: ”Ansaitset olla finaalissa”

    9. 9

      Imatralla tapahtui öinen ampumavälikohtaus – Yle: Kolme ihmistä kuollut

    10. 10

      MTV:n teiniäiti poseerasi uhkeana uusissa kalenterikuvissa – muistatko vielä kohut? Tienasi 1,5 miljoonaa seksivideolla vuonna 2013

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Raju huhu Lewis Hamiltonista – ”Se on yksityisasia”

    2. 2

      Sorrutko sinäkin aina näihin virheisiin? 4 asiaa, jotka kannattaa jättää väliin ennen seksiä

    3. 3

      7 yleisen syövän varhaiset varoitusmerkit – tunnista ajoissa

    4. 4

      Raakel Lignellin raju painonpudotus ja tiukka ruokavalio johtivat pysyviin terveysongelmiin: ”Riistäytyi vähän käsistä”

    5. 5

      WhatsApp katoaa miljoonista puhelimista – katso, onko omasi listalla

    6. 6

      Nainen teki ”pettämistestin” poikaystävälleen – lopputulos ei ilahduttanut, videolla jo 6 miljoonaa katselukertaa

    7. 7

      Aleksi Valavuori julkaisi matkakuvan Los Angelesista: maisemaotos paljastuikin Ikean sisustustauluksi – some repesi

    8. 8

      Eija, 32, huomasi vauvansa olevan erilainen – elämä muuttui pikkuhiljaa painajaiseksi

    9. 9

      Tuulenvire paljasti Donald Trumpin omituisen ”asumokan” – netti sekosi lentokentältä napatusta kuvasta

    10. 10

      Saara Aalto teki historiallisen tempun – kukaan muu brittien X Factorissa ei ole kyennyt samaan

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Viranomaisvahvistus: Imatran ampumavälikohtauksessa kolme kuolonuhria

    2. 2

      Uutisvuodon Sipilä-vitsi hämmensi lauantai-iltana – Mitä lähetyksessä tapahtui?

    3. 3

      Imatralla tapahtui öinen ampumavälikohtaus – Yle: Kolme ihmistä kuollut

    4. 4

      Näillä uskomattomilla esityksillä Saara Aalto laittoi tuomarit jälleen polvilleen – katso näyttävät videot

    5. 5

      Hurja tahti jatkuu – Patrik Laine nousi takaisin maalipörssin kärkeen

    6. Näytä lisää
    1. 1

      WhatsApp katoaa miljoonista puhelimista – katso, onko omasi listalla

    2. 2

      Tuulenvire paljasti Donald Trumpin omituisen ”asumokan” – netti sekosi lentokentältä napatusta kuvasta

    3. 3

      New York Times kertoo 44-vuotiaan suomalaismiljonäärin uskomattoman tarinan: luksuselämää ja satojen miljoonien avioerotaistelu

    4. 4

      Vappu Pimiältä roisi paljastus MTV:lle – rinnat täysin paljaana Tanssii Tähtien Kanssa -kulisseissa: ”Mikko repi puvun auki”

    5. 5

      Kurveistaan tunnettu matkabloggaaja vietti kolme viikkoa Suomessa – upeat kuvat villitsevät netissä: ”Mieletön paikka”

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Raju huhu Lewis Hamiltonista – ”Se on yksityisasia”

    2. 2

      Sorrutko sinäkin aina näihin virheisiin? 4 asiaa, jotka kannattaa jättää väliin ennen seksiä

    3. 3

      7 yleisen syövän varhaiset varoitusmerkit – tunnista ajoissa

    4. 4

      Raakel Lignellin raju painonpudotus ja tiukka ruokavalio johtivat pysyviin terveysongelmiin: ”Riistäytyi vähän käsistä”

    5. 5

      WhatsApp katoaa miljoonista puhelimista – katso, onko omasi listalla

    6. Näytä lisää