Digitoday

Valikko

Datainfra Euroopan biologiselle tutkimustiedolle

Uudessa EU:n 4,5 miljoonan euron projektissa luodaan eurooppalaisen biologisen tutkimustiedon datalle pysyvä infrastruktuuri.
Euroopan komissio on myöntänyt ELIXIR (European Life Science Infrastructure for Biological Information) -projektille 4,5 miljoonaa euroa valmistelurahaa.

Yleiseurooppalaisen Elixir-projektin valmisteluvaiheen tarkoituksena on löytää paras tapa Euroopan erillisten biologisten dataresurssien yhdistämiseen yhdeksi pysyväksi biotieteiden infrastruktuuriksi.

Korkealla infrastruktuurien ranking-listalla

Tutkimusinfrastruktuureja käsittelevä eurooppalainen strategiafoorumi ESFRI on julkaissut listan merkittävimmistä tutkimuslaitteistoista ja muista infrastruktuureista, joita Eurooppaan tulisi tulevaisuudessa rakentaa. ELIXIR-projekti on yksi näistä.

Tapa, jolla biologista, kuten nukleiinihappoihin, proteiinisekvensseihin ja suurimolekyylisiin rakenteisiin liittyvää tietoa säilytetään, on muuttunut 1980-luvun jälkeen merkittävästi.

Muistivihoista ja akateemisista julkaisuista on päädytty avoimen lähdekoodin tietokantoihin, joissa tietoa on jaettu maailmanlaajuisesti päivittäin.

Nämä tietokannat, ja niissä oleva tieto, ovat korvaamattomia resursseja modernissa biologiassa. Tähän asti ne ovat kuitenkin olleet usein riippuvaisia epävarmasta rahoituksesta, jolloin arvokas data on ollut uhattuna rahoituksen päättyessä.

ELIXIR-projektin tavoite on suojella sekä tietokannoissa jo olemassa olevaa kallisarvoista tietoa että tulevaisuudessa syntyvää dataa. Projekti suunnittelee Eurooppaan optimoidun biotieteiden verkoston, jonka käyttöä tukee vakaa rahoitus.

Tällaisen verkoston perustaminen on strategisesti tärkeä askel, jotta Eurooppa voisi säilyttää johtoasemansa tieteellisessä tutkimuksessa.

Suomesta CSC mukana hankkeessa

ELIXIR-projektia ohjaa eurooppalainen bioinformatiikan tutkimuskeskus EBI (European Bioinformatics Institute). EBI on osa EMBL:ää (European Molecular Biology Laboratory), joka on Euroopan johtava molekyylibiologian tutkimuslaitos. Projektissa on mukana 32 partneria 13 eri maasta.

Tieteen tietotekniikan keskus CSC edustaa Suomea ELIXIRissä. Valmisteluvaiheessa tärkeä tavoite on löytää suomalaisille sopiva rooli muiden eurooppalaisten partnereiden joukossa yhteisessä tutkimuksen infrastruktuurissa.

- On olennaista tunnistaa Suomen tutkimukselle ja elinkeinoelämälle olennaisimmat biologiset dataresurssit ELIXIRissä sekä muodostaa kontakteja ELIXIRin toimintaa täydentäville alueille, kuten lääketieteelliseen tutkimukseen, Tommi Nyrönen CSC:stä sanoo tiedotteen mukaan.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Tullin rakastettu huumekoira Dani tassutteli eläkkeelle – teki vielä viimeisenä työpäivänään löydön

    2. 2

      Pariskunta ei arvannut, mihin lähti paritalon puolikkaan ostaessaan – piina vei oikeuteen seitsemän kertaa

    3. 3

      Ratamoottoripyöräilyn huippulahjakkuus lopetti uransa vain 22-vuotiaana – syyksi paljastui karmea hyväksikäyttö

    4. 4

      Tarkista ja kuuntele: Mikä oli Suomen listaykkösenä, kun sinä synnyit?

    5. 5

      Päävalmentaja ei yllättynyt Janne Ahosen huippuhypystä MM-karsinnassa – ”Hän on valmis näihin kisoihin”

    6. 6

      Suosikkijuontaja Tuija Pehkoselta avoin kirjoitus vartalostaan – säästi rahaa silikonirintoihin: ”Puristelin rintojani muhkeammiksi”

    7. 7

      Helsinkiläinen Nina, 44, avautuu isäpuolen järkyttävistä teoista: ”Äiti katseli vierestä, mutta ei koskaan puuttunut”

    8. 8

      ”Inhoan tätä elämää, voisinpa vain antaa lapset pois”

    9. 9

      Hyvinkään poliisiasemalle saapui ahdistunut aviomies – elintasokulissin takaa alkoi paljastua karu totuus

    10. 10

      Venezuelan kohuhiihtäjältä yllätys: lahjoittaa isot palkintosekit kahdelle suomalaisurheilijalle!

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Helsinkiläinen Nina, 44, avautuu isäpuolen järkyttävistä teoista: ”Äiti katseli vierestä, mutta ei koskaan puuttunut”

    2. 2

      Katri Sorsalta kuitti Anu Saagimille: ”Eestissä nainen näyttää herättyään tältä, meillä Suomessa tältä...”

    3. 3

      Hyvinkään poliisiasemalle saapui ahdistunut aviomies – elintasokulissin takaa alkoi paljastua karu totuus

    4. 4

      Joukko tv-kanavia uhkaa pian pimentyä yli 1,5 miljoonassa kodissa

    5. 5

      Onko tässä totuus Mäkäräisen poisjäännistä Lahden MM-kisoista? ”Kaikki, mitä Otepäässä tulkitsin Reijon olemuksesta ja puheista, viittasi siihen”

    6. 6

      Pariskunta ei arvannut, mihin lähti paritalon puolikkaan ostaessaan – piina vei oikeuteen seitsemän kertaa

    7. 7

      Tarkista ja kuuntele: Mikä oli Suomen listaykkösenä, kun sinä synnyit?

    8. 8

      Jenni, 24, on aseksuaali: ”Tavallaan toivon, että olisin edelleen neitsyt”

    9. 9

      Miss Thaimaan, 22, uskomaton muodonmuutos – ”nörtistä” kuoriutui 6 kuukaudessa upea kaunotar: ”En ole ikinä seurustellut”

    10. 10

      ”Inhoan tätä elämää, voisinpa vain antaa lapset pois”

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Julkkiksilta sataa tukea rumaksi haukutulle Maria Veitolalle – Rakel Liekiltä tyhjentävä kommentti

    2. 2

      Kummisetä antoi 10-vuotiaalle tyttärelle lahjarahaa – Kela rokotti koko perheeltä 341,52 euroa/kk

    3. 3

      Pekka Vähäsöyrinki tunnusti Mika Myllylän haudalla, milloin dopinginkäyttö alkoi: ”Siinä hetkessä annoin periksi”

    4. 4

      Traaginen onnettomuus Helsingissä – työkoneen kauha osui kävelijään, nainen kuoli vammoihinsa

    5. 5

      Stubb opetti Trumpille faktoja Ruotsista – viesti sytytti kiivaan keskustelun

    6. 6

      Helsinkiläinen Nina, 44, avautuu isäpuolen järkyttävistä teoista: ”Äiti katseli vierestä, mutta ei koskaan puuttunut”

    7. 7

      Yleinen virhe wc-pöntöllä: Tästä syystä pyttyyn jää helposti ”jarrutusjäljet”

    8. 8

      Anu Saagim haukkui Maria Veitolaa rumaksi suorassa lähetyksessä – Veitola harmistui studioyleisön reaktiosta: ”Yleisö nauraa ja taputtaa”

    9. 9

      Nokialla pahoinpidelty 17-vuotias tyttö on kuollut

    10. 10

      Donald Trumpilta outo viittaus Ruotsiin: ”Katsokaa, mitä tapahtui eilen illalla Ruotsissa – kuka olisi uskonut?”

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Tullin rakastettu huumekoira Dani tassutteli eläkkeelle – teki vielä viimeisenä työpäivänään löydön

    2. 2

      Pariskunta ei arvannut, mihin lähti paritalon puolikkaan ostaessaan – piina vei oikeuteen seitsemän kertaa

    3. 3

      Ratamoottoripyöräilyn huippulahjakkuus lopetti uransa vain 22-vuotiaana – syyksi paljastui karmea hyväksikäyttö

    4. 4

      Tarkista ja kuuntele: Mikä oli Suomen listaykkösenä, kun sinä synnyit?

    5. 5

      Päävalmentaja ei yllättynyt Janne Ahosen huippuhypystä MM-karsinnassa – ”Hän on valmis näihin kisoihin”

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Helsinkiläinen Nina, 44, avautuu isäpuolen järkyttävistä teoista: ”Äiti katseli vierestä, mutta ei koskaan puuttunut”

    2. 2

      Katri Sorsalta kuitti Anu Saagimille: ”Eestissä nainen näyttää herättyään tältä, meillä Suomessa tältä...”

    3. 3

      Hyvinkään poliisiasemalle saapui ahdistunut aviomies – elintasokulissin takaa alkoi paljastua karu totuus

    4. 4

      Joukko tv-kanavia uhkaa pian pimentyä yli 1,5 miljoonassa kodissa

    5. 5

      Onko tässä totuus Mäkäräisen poisjäännistä Lahden MM-kisoista? ”Kaikki, mitä Otepäässä tulkitsin Reijon olemuksesta ja puheista, viittasi siihen”

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Julkkiksilta sataa tukea rumaksi haukutulle Maria Veitolalle – Rakel Liekiltä tyhjentävä kommentti

    2. 2

      Kummisetä antoi 10-vuotiaalle tyttärelle lahjarahaa – Kela rokotti koko perheeltä 341,52 euroa/kk

    3. 3

      Pekka Vähäsöyrinki tunnusti Mika Myllylän haudalla, milloin dopinginkäyttö alkoi: ”Siinä hetkessä annoin periksi”

    4. 4

      Traaginen onnettomuus Helsingissä – työkoneen kauha osui kävelijään, nainen kuoli vammoihinsa

    5. 5

      Stubb opetti Trumpille faktoja Ruotsista – viesti sytytti kiivaan keskustelun

    6. Näytä lisää