Digitoday

Valikko

Datainfra Euroopan biologiselle tutkimustiedolle

Uudessa EU:n 4,5 miljoonan euron projektissa luodaan eurooppalaisen biologisen tutkimustiedon datalle pysyvä infrastruktuuri.
Euroopan komissio on myöntänyt ELIXIR (European Life Science Infrastructure for Biological Information) -projektille 4,5 miljoonaa euroa valmistelurahaa.

Yleiseurooppalaisen Elixir-projektin valmisteluvaiheen tarkoituksena on löytää paras tapa Euroopan erillisten biologisten dataresurssien yhdistämiseen yhdeksi pysyväksi biotieteiden infrastruktuuriksi.

Korkealla infrastruktuurien ranking-listalla

Tutkimusinfrastruktuureja käsittelevä eurooppalainen strategiafoorumi ESFRI on julkaissut listan merkittävimmistä tutkimuslaitteistoista ja muista infrastruktuureista, joita Eurooppaan tulisi tulevaisuudessa rakentaa. ELIXIR-projekti on yksi näistä.

Tapa, jolla biologista, kuten nukleiinihappoihin, proteiinisekvensseihin ja suurimolekyylisiin rakenteisiin liittyvää tietoa säilytetään, on muuttunut 1980-luvun jälkeen merkittävästi.

Muistivihoista ja akateemisista julkaisuista on päädytty avoimen lähdekoodin tietokantoihin, joissa tietoa on jaettu maailmanlaajuisesti päivittäin.

Nämä tietokannat, ja niissä oleva tieto, ovat korvaamattomia resursseja modernissa biologiassa. Tähän asti ne ovat kuitenkin olleet usein riippuvaisia epävarmasta rahoituksesta, jolloin arvokas data on ollut uhattuna rahoituksen päättyessä.

ELIXIR-projektin tavoite on suojella sekä tietokannoissa jo olemassa olevaa kallisarvoista tietoa että tulevaisuudessa syntyvää dataa. Projekti suunnittelee Eurooppaan optimoidun biotieteiden verkoston, jonka käyttöä tukee vakaa rahoitus.

Tällaisen verkoston perustaminen on strategisesti tärkeä askel, jotta Eurooppa voisi säilyttää johtoasemansa tieteellisessä tutkimuksessa.

Suomesta CSC mukana hankkeessa

ELIXIR-projektia ohjaa eurooppalainen bioinformatiikan tutkimuskeskus EBI (European Bioinformatics Institute). EBI on osa EMBL:ää (European Molecular Biology Laboratory), joka on Euroopan johtava molekyylibiologian tutkimuslaitos. Projektissa on mukana 32 partneria 13 eri maasta.

Tieteen tietotekniikan keskus CSC edustaa Suomea ELIXIRissä. Valmisteluvaiheessa tärkeä tavoite on löytää suomalaisille sopiva rooli muiden eurooppalaisten partnereiden joukossa yhteisessä tutkimuksen infrastruktuurissa.

- On olennaista tunnistaa Suomen tutkimukselle ja elinkeinoelämälle olennaisimmat biologiset dataresurssit ELIXIRissä sekä muodostaa kontakteja ELIXIRin toimintaa täydentäville alueille, kuten lääketieteelliseen tutkimukseen, Tommi Nyrönen CSC:stä sanoo tiedotteen mukaan.

Kommentit

    Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Poliisi sai sarjahukuttajan kiinni Joensuussa

    2. 2

      Intiimi hetki sian kanssa – Oulun poliisi otti oudon miehen kiinni ojasta

    3. 3

      Valtava jäävuori uhkaa irrota Etelämantereelta – kauhuskenaariona maailmanlaajuiset seuraukset

    4. 4

      Trump-vastainen Naisten marssi valtaa Washingtonin – luvassa jopa isompi tapahtuma kuin virkaanastujaiset

    5. 5

      George W. Bushin taistelu kertakäyttösadetakin kanssa varasti huomion Trumpin virkaanastujaisissa – internet sekosi kuvasarjasta

    6. 6

      ”Elämme pimeitä aikoja” – Suomalaiset päättäjät huolestuivat Trumpin puheesta sosiaalisessa mediassa

    7. 7

      Asianajaja kuuli sarjahukuttajan kiinniotosta rouvaltaan

    8. 8

      Upea hiihto! Krista Pärmäkoski sijoittui toiseksi maailmancupin osakilpailussa

    9. 9

      Mikä kaunotar! Ivanka Trump, 35, käänsi katseet vaaleanpunaisessa prinsessapuvussaan

    10. 10

      Sarjahukuttaja oli palkittu karjatilallinen – sitten tapahtui jotakin

    11. Näytä lisää
    1. 1

      IS seurasi hetki hetkeltä: Trumpin ensimmäinen päivä presidenttinä huipentui tanssiaisiin

    2. 2

      6 yleistä virhettä, jotka sinäkin luultavasti teet joka kerta suihkussa

    3. 3

      Mikä kaunotar! Ivanka Trump, 35, käänsi katseet vaaleanpunaisessa prinsessapuvussaan

    4. 4

      Uimapukumalli Chrissy Teigen jakoi rehellisen kuvan reisistään – miehet hämmentyivät: ”Olen katsonut tätä jo minuutin, ja...”

    5. 5

      Kiusallinen sekaannus Melania Trumpin ja Michelle Obaman välillä – presidenttiparit pyörivät Valkoisen talon portailla hämmentyneinä

    6. 6

      Kumppaniaan pettänyt listaa: ”Olisinpa tiennyt nämä asiat ennen kuin petin”

    7. 7

      Sarjahukuttajan puhelin hälyttää, mutta missä? Poliisin paikannusyritys jäi tuloksettomaksi

    8. 8

      Tappolistat, agentit, vakoilusatelliitit... 8 salaisuutta, jotka Donald Trump saa tietää virkaan astuttuaan

    9. 9

      Psykologi lataa: ADHD-tyyppisistä oireista suuri osa johtuu vanhemmuuden puutteesta

    10. 10

      Valtava jäävuori uhkaa irrota Etelämantereelta – kauhuskenaariona maailmanlaajuiset seuraukset

    11. Näytä lisää
    1. 1

      Juo aamulla vettä tyhjään vatsaan – 8 mahtavaa vaikutusta

    2. 2

      Häikäisevän kaunis morsian! Mika Häkkinen ja Marketa pääsivät poroajelun kyytiin – suloiset lapset mukana

    3. 3

      Mikan ja Marketan rakkaustarina – saksalaislehti paljasti kaunottaren menneisyyden

    4. 4

      Perhe etsii vastausta kammottavaan kuvaan – mitä tai mikä ilmestyi yhtäkkiä yöllä kotipihalla otettuun valokuvaan?

    5. 5

      Serbian seksikkäin laulaja Milica, 25, purskahti korsetistaan ulos kesken keikan – yleisö villiintyi

    6. 6

      Nainen synnytti salaa vessassa – raskaudesta tietämättömät vanhemmat havahtuivat pamaukseen

    7. 7

      Kolme povekasta blondia: Natalie, 45, sekoitetaan jatkuvasti tyttäriinsä – erotatko kuvista kuka on äiti?

    8. 8

      Yksi kuoli rekan pudottua moottoritieltä Lohjalla – erikoinen tapahtumaketju johti karmeaan turmaan

    9. 9

      Dramaattiset kuvat: Myrskypuuska romahdutti rakenteilla olleen, yli 100-neliöisen talon maan tasalle Kuopiossa

    10. 10

      Floridan poliisi julkaisi mykistävän videon rämeeltä – ”Kuka sanoi, että dinosaurukset ovat kuolleet sukupuuttoon?”

    11. Näytä lisää

    Näitä luetaan!

    1. 1

      Poliisi sai sarjahukuttajan kiinni Joensuussa

    2. 2

      Intiimi hetki sian kanssa – Oulun poliisi otti oudon miehen kiinni ojasta

    3. 3

      Valtava jäävuori uhkaa irrota Etelämantereelta – kauhuskenaariona maailmanlaajuiset seuraukset

    4. 4

      Trump-vastainen Naisten marssi valtaa Washingtonin – luvassa jopa isompi tapahtuma kuin virkaanastujaiset

    5. 5

      George W. Bushin taistelu kertakäyttösadetakin kanssa varasti huomion Trumpin virkaanastujaisissa – internet sekosi kuvasarjasta

    6. Näytä lisää
    1. 1

      IS seurasi hetki hetkeltä: Trumpin ensimmäinen päivä presidenttinä huipentui tanssiaisiin

    2. 2

      6 yleistä virhettä, jotka sinäkin luultavasti teet joka kerta suihkussa

    3. 3

      Mikä kaunotar! Ivanka Trump, 35, käänsi katseet vaaleanpunaisessa prinsessapuvussaan

    4. 4

      Uimapukumalli Chrissy Teigen jakoi rehellisen kuvan reisistään – miehet hämmentyivät: ”Olen katsonut tätä jo minuutin, ja...”

    5. 5

      Kiusallinen sekaannus Melania Trumpin ja Michelle Obaman välillä – presidenttiparit pyörivät Valkoisen talon portailla hämmentyneinä

    6. Näytä lisää
    1. 1

      Juo aamulla vettä tyhjään vatsaan – 8 mahtavaa vaikutusta

    2. 2

      Häikäisevän kaunis morsian! Mika Häkkinen ja Marketa pääsivät poroajelun kyytiin – suloiset lapset mukana

    3. 3

      Mikan ja Marketan rakkaustarina – saksalaislehti paljasti kaunottaren menneisyyden

    4. 4

      Perhe etsii vastausta kammottavaan kuvaan – mitä tai mikä ilmestyi yhtäkkiä yöllä kotipihalla otettuun valokuvaan?

    5. 5

      Serbian seksikkäin laulaja Milica, 25, purskahti korsetistaan ulos kesken keikan – yleisö villiintyi

    6. Näytä lisää